IF=9.5分!這本生信友好黑馬“神刊”!國人友好,一投一準!

哈嘍,大家好,這裡是“SCI難產急救室”的醫學人嘮嗑現場。👇
家人們,我剛寫完一篇生信,投哪個期刊比較好?

生信啊,現在純生信可不好投了,你要寫得乾溼結合的就還好
呵呵,我論文都投出3個月了,至今還沒有訊息

投稿別死磕啊!投出去沒信兒的當務之急是寫一封催稿信,還沒訊息的話就趕緊撤稿另投其他期刊試試
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例如,正在徵稿多組學研究的IF9+SCI國人友好生信神刊《Biomarker Research》;復旦華人主編國人生信友好的IF10.6期刊《Clinical and Translational Medicine》……
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選刊投稿雖不易,但如何能快速寫完一篇SCI文章才更讓人頭疼!
眾所周知,我們醫學人頭等難治的心病非發SCI莫屬,畢業、申獎、晉升,有時就差那麼一篇關鍵SCI。
時間緊迫,事項繁多,又絕對不能踏過論文代發代寫紅線,如何破局?
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3+SCI通用套路設計框架↓
1. 單基因腫瘤套路
2. 非腫瘤套路
3. 表型套路
4. 機器學習套路
5. 單細胞多組學套路
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接下來,小編帶大家淺淺瞭解一下這5種發文套路~👇
1. 單基因腫瘤套路
單基因腫瘤分析套路,這是一種透過分析特定基因在腫瘤中的表達變化及其功能,揭示基因在腫瘤發生發展中的作用的方法。
單基因腫瘤套路的優勢,包括上手快、易於發表文章、可遷移性強等。
🔻單基因腫瘤分析的一般步驟,即“挑圈聯靠”模型:
  • 挑:指確定研究物件,即選擇一個感興趣的基因;
  • 圈:指進行基因的功能聚類/富集分析;
  • 聯:指進行基因與其它變數如免疫細胞浸潤、蛋白互作等的相關性分析;
  • 靠:指進行基因與臨床特徵之間的關係分析。
單基因腫瘤分析不僅可以幫助我們揭示腫瘤發生發展的分子機制,還可以為腫瘤的診斷、治療和預後提供重要的參考依據。
總而言之,單基因腫瘤分析是一種重要的生信分析方法,值得大家深入研究。
2. 非腫瘤套路
非腫瘤生信分析的本質和它的難點:
非腫瘤生信分析與腫瘤生信分析本質相同,都遵循“挑圈聯靠”四大模組。
而非腫瘤生信分析的難點在於資料集獲取難度大,線上分析資料庫較少,資料內容多樣且涉及不同物種和條件。此外,非腫瘤資料庫中預後資訊資料也相對較少。
🔻非腫瘤生信分析的一般步驟:
  • 挑:篩選差異表達基因
  • 圈:進行GO和KEGG富集分析,揭示基因功能或進行聚類等
  • 聯:進行免疫浸潤分析、免疫浸潤相關性分析等相關性分析,探究基因與其它生命活動/功能的關係
  • 靠:運用隨機森林、LASSO迴歸等演算法,篩選出關鍵基因或構建預測模型
我們以麻風病為例,整合GEO資料庫中5個麻風病相關資料集,透過WGCNA和DEG分析篩選出關鍵基因。對關鍵基因進行GO和KEGG富集分析,發現其與T細胞啟用、細胞因子產生、趨化因子訊號通路等密切相關。構建了PPI網路並識別出兩個關鍵模組,結合免疫相關通路分析,揭示了關鍵基因與免疫通路之間的互作關係。最終確定了10個關鍵基因和6個關鍵訊號通路,並探討了其作為麻風病診斷和治療潛在生物標誌物的可能性。
非腫瘤生信分析能夠為非腫瘤疾病的診斷、治療和發病機制研究提供新的思路。透過整合多種資料和套路,能夠更深入地分析非腫瘤疾病及其相關特徵。
3. 表型套路
表型套路的核心是研究特定生理或病理過程(表型)與疾病之間的關係透過篩選出與表型相關的基因列表,並結合疾病相關的基因進行分析,可以揭示疾病背後的生物學機制,併為疾病的治療提供新的思路。
🔻表型套路的分析流程一般包括以下步驟:
  • 資料獲取:從公共資料庫或文獻中獲取疾病相關和表型相關的基因資料。
  • 差異表達分析:分析疾病組和對照組之間的基因表達差異,篩選出差異表達基因。
  • 交集篩選:將差異表達基因與表型相關基因取交集,獲得與疾病和表型都相關的基因列表。
  • 功能富集分析:對篩選出的基因進行功能富集分析,揭示其生物學功能和參與的通路。
  • 免疫浸潤分析:分析疾病樣本中免疫細胞的浸潤情況。
  • 相關性分析:分析關鍵基因與免疫細胞浸潤之間的相關性,揭示疾病發生的分子機制。
為了更好地理解雙疾病套路的實際應用,透過篩選出某疾病中差異表達的如鐵死亡相關基因,並進行功能富集分析和免疫浸潤分析,最終確定了六個關鍵基因,並揭示了這些基因與免疫細胞浸潤之間的相關性,為疾病的治療提供了新的思路。
📌篇幅有限,機器學習套路、單細胞組學套路這裡就不多做介紹了~
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寫在最後:
我只能說生信不僅火,最主要適合我等被放養的悲慘菜鳥!
為啥?因為搞科研這個活兒,難度係數實在是太高。
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而生信呢——
🔥不用跪求儀器共享
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說白了,生信就是窮鬼科研圈的拼多多!三個月肝出SCI救命符,職稱評審直接甩出三區保底!  
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總而言之,他會讓你們把理論轉化為實際,輕鬆玩轉生信分析,挖挖資料,小白也能抓住這波發文機遇,在2025衝擊更多更高分SCI!
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END

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