近日,國內很多碩博發文量巨大的SEER公共資料庫已禁止中國作者使用的訊息已經傳遍了學術界,受到廣泛關注。
受NIH管控,其他訪問受控的資料庫包括基因型和表型資料庫dbGaP、NCI基因組資源、CDS癌症資料服務等。
有網友擔心:用其公共資料發表的SCI是否會收到新規的影響?畢業/晉升是否還能用?
目前看來暫時還沒有定論。

不過這件事已經定局,對於SEER資料探勘受阻的小夥伴來說,為了保畢業/穩晉升,及時調整自己的課題方案和發文策略才是更重要的!
復旦博士&生信圈大神 雪球老師已經整理了一些值得參考的、申請流程簡單的方法!這下新手小白也也不怕研究受阻了!
一、涉及分子機制或精準醫療方向
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直接掉頭,使用TCGA/GEO等資料來做生信。還有,美國國家癌症研究所NCI下屬的癌症影像檔案館TCIA,可以進行影像組學方面的挖掘(影像組學資料可用“預製”演算法處理,門檻並非高不可攀!);
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如果擔心TGCA/GEO同屬於NIH會被波及,可以考慮回到國際核苷酸序列資料庫合作聯盟(INSDC),使用EMBL等資料庫進行分析;
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使用整合了126個腫瘤基因組研究的資料(包括TCGA、ICGC),由多機構團隊開發和維護的cBioPortal;或使用自測資料開展針對性更強的分析等。


二、涉及人口層面流行病學研究
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可使用世界衛生組織下屬國際癌症研究機構IARC釋出的全球癌症統計資料庫——GLOBOCAN;
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可使用IHME牽頭的全球性疾病負擔資料庫——GBD(Global Burden of Disease);
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也可使用中國國家癌症中心NCC、中國疾控中心CDC資料等。
三、涉及臨床決策支援
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除了獲取TCGA、cBioPortal等資料庫中的臨床資料外,也可以申請國內醫院臨床資料庫,開展科研合作。
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我們國家也有“自己的NCBI”——國家生物資訊中心(CNCB),是獲得CNS頂刊認可的資料庫。

好啦,看完你們有中意的資料庫了嘛?
目前來看,TCGA和GEO等資料庫還可以正常使用,之前預測可能遭到停用的NHANES、MIMIC等資料庫還可以正常訪問與獲取。
要知道,資料獲取還不算難,SEER倒了,也還有能挖的資料庫。難的是選題、資料分析和寫作!但現在,選題和資料分析有我們,SCI寫作也有我們!
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接下來,咱們就來跟著雪球老師的思路,學習如何能不做實驗,巧妙運用熱門公共臨床資料庫,拿下5分+臨床SCI文章~
相信大部分臨床醫生和專碩的困擾都是「要發文章但是沒有實驗條件和原始資料」,可謂是“巧婦難為無米之炊”!
但其實公共資料庫就是現成的糧食啊,做熟就能吃了,幾乎所有大大小小的科室都能挖!


課上雪球老師為大家逐一介紹了當然熱門的公共臨床資料庫,及其對應的資料探勘策略,瞭解它們的資料型別,發文情況與挖掘難易程度。


尤其是近些年大名鼎鼎的NHANES資料庫,如果你沒聽過,那真的就太落伍了,可以說是毫無科研敏銳度。
從2006年開始,NHANES資料庫的發文量就開始逐年遞增,目前總髮文量已超過7.7W篇,2025年剛過去3個月就已經發布了2,744篇!發文潛力巨大!
而且好發高分,妥妥的晉升寶藏!

2025年2月,暨南大學醫學院聯合第二軍醫大學團隊剛剛在“MedComm(10.7)期刊上發表了一篇NHANES資料庫挖掘的純分析文章。
旨在使用NHANES資料庫和UKB資料庫兩個佇列的資料進行了一項綜合研究,以探討MAFLD和SLD亞分類與肝臟相關不良結局的相關性,並透過北京FH健康佇列研究(FHCS)的病例對照研究進行了驗證。

課上,雪球老師就以NHANES資料庫為例,詳細介紹了它的資料調查範圍、資料型別與特點,以及資料探勘和分析的實戰方法。
NHANES資料庫介紹
NHANES(National Health and Nutrition Examination Survey)是美國一項具有代表性的全國性健康和營養調查專案,旨在透過綜合性的健康和營養評估來監控美國民眾的健康趨勢和生活方式的變化。


每兩年一個週期,每個週期調研1~2萬人左右。收集的資料涵蓋了人口統計學資訊、營養攝入、實驗室測試、體格檢查以及生活方式和社會經濟調查等多個領域。前不久,Nhanes資料庫更新了2021年~2023年的資料,新增1.1萬受訪者資料。
NHANES資料庫的資料對公眾開放,研究者無需任何手續即可直接從官方網站下載所需資料,無需申請或倫理審批。
只要搞清楚NHANES的橫斷面和抽樣加權的特點,資料分析處理就簡單多了,新手小白做一項橫斷面研究只需要學習基礎的描述性統計分析與 Logistic迴歸即可。
NHANES資料探勘策略
NHANES資料庫👍指標多👍資料全👍可挖掘空間大,妥妥的新晉發文藍海!
但到底從哪裡入手?怎麼挖才好發?說真的,即便是問過DeepSeek,新手小白也難以看懂……
彆著急!雪球老師在課上為大家準備了詳細的NHANES資料探勘方法:目標資料怎麼找?“權重”是啥?怎麼“新增權重”?協變數又是什麼?……快跟著老師一起學起來~



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0程式碼搞定NHANES資料分析!
資料搞到,選題有了方向,但如果你不會分析,發文週期也會拉的無限長……
雪球老師將會帶大家學習如何善用0程式碼分析工具–仙桃學術,快速搞定NHANES資料分析及其資料視覺化作圖。
仙桃學術工具是一款不用R就可以進行資料分析的工具,可以做到一鍵出圖!無需學R,SCI發表級高畫質圖片分分鐘生成!

為了讓大家更直觀地感受和掌握仙桃工具0程式碼分析、出圖的威力,雪球老師精心挑選了極具代表性的NHANES發文例項,詳細展示如何透過仙桃工具精準復現文章中的關鍵分析步驟和視覺化結果。




想要高效率搞定SCI文章,少不了AI工具幫幫忙!
AI工具那麼多哪個更適合咱們醫學黨?要知道,不同型別的AI工具,對於產出SCI文章可是有不同的作用的。
比如,2025年爆火全網的問答式AI工具–DeepSeek,透過對它進行提問,你不僅可以生成SCI文章,還可以透過它的深度思考部分獲取更多的寫作靈感,更好的理清寫作思路和重點。
雪球老師在課上分享了DeepSeek的使用心得和技巧,並實操演示手把手教學。

再比如,如果你覺得覺得提示詞學起來太難,擔心DeepSeek在生成SCI文章時捏造虛假參考文獻,那就可以試試我們的醫學科研專用型AI工具——NewIdea。
針對SCI寫作這一科研場景,我們的NewIdea專門打造了AI寫作模組,無論是論著or綜述,無論是撰寫初稿or精修降重,僅需根據提示詞輸入相應內容就能輕鬆搞定一篇SCI文章。

更重要的是,它接入了PubMed和其他真實文獻庫,並且經過了醫學領域AI訓練師的專業最佳化,生成後的內容將自動檢索並引用真實參考文獻,保證了內容的質量和可靠性!

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