IF=12.5!一作竟是本科生?兩個月就發表,知道真相後我震驚了……(附套路可復現)

去年“孟德爾隨機化”爆火,透過PubMed資料庫檢索孟德爾就能發現,孟德爾隨機化早已是SCI的又一片藍海~
此處說的「藍海」是真的!就在2024年3月18日,山東中醫藥大學本科生,僅用了兩個月就在期刊《International Journal of Surgery》上發表了一篇IF12.5的高分SCI這篇文章中就是做了雙向雙樣本的孟德爾隨機化!
孟德爾隨機化到底有什麼優勢,能讓本科生輕鬆發表高分SCI?!總結一下,這四點已經足夠打敗其他臨床分析了👇
1.從發表SCI角度來看,孟德爾隨機化無需複雜實驗設計、資料易獲取、容易發高分;
2.從研究方法上來看,孟德爾隨機化可以推導因果關係,且可以避免混雜因素影響;
3.相對其他型別而言,可靠性高,遺傳變異與其效應的測量誤差較小;
4.並不一定要找到因果SNP一個與因果SNP處於連鎖不平衡的SNP即可滿足假設條件。
本科生都可以一作發表高分SCI,足以見得孟德爾隨機化的發文潛力!也鑑於此,解螺旋早已第一時間為大家梳理了孟德爾隨機化的前世今生,心動不如行動,感興趣的同學趕緊一起來看看這片發文藍海!
01
孟德爾隨機化的核心邏輯
孟德爾隨機化是流行病學領域應用廣泛的一種實驗設計方法,它透過引入中間變數(即工具變數)來分析暴露因素和結局之間的因果關係,能有效解決傳統觀察性研究中存在的混雜因素影響的問題,得出可信的因果關係。
MR原理展示圖
我們進行孟德爾隨機化時,最想得到的就是暴露因素X和結局變數Y的關係,也就是準確估算的b。按上圖已知ZY關係為ab,ZX關係為a,按照數學邏輯圖例,b可由ab/a而獲得。也就是說:我們只需要得知Z-Y的關係係數ab和Z-X的關係係數a,就能間接獲得b。
而ZY指代工具變數中基因Z與結局Y的關係,相關資料前人已經幫我們研究好了,就藏在GWAS的summary data裡;ZX表示基因Z與暴露因素X的關係,同樣可以在GWAS的summary data裡直接找到。
換而言之,透過孟德爾隨機化,我們完全可以繞過最繁瑣、最容易參雜混雜因素的步驟來估算出想要知道的b,也就是暴露和結局的因果關係,瞬間事半功倍!
02
孟德爾隨機化的分析流程
知道了孟德爾隨機化的分析原理、核心邏輯和工具變數的選取,接下來帶大家熟悉一下孟德爾隨機化的分析流程,掌握了分析步驟,才能更有針對性的去學習孟德爾隨機化。
01
讀取暴露因素的GWAS資料
02
選取合適的工具
通常設定為P< 5×10-8,必要時進行clumping
03
讀取結局變數的GWAS資料
提取上述工具變數的SNP(變異頻率大於1%的單核苷酸變異)
04
資料預處理
對暴露因素與結局的GWAS資料進行預處理,使其格式統一化
05
MR分析SNPs與結局的關係
預設使用五種方法為MR Egger,Weighted median,Inverse variance weighted,Simple mode ,Weighted mode,多用效應值(β)或者風險值(OR)表示
06
分析結果視覺化
包括散點圖、森林圖和漏斗圖等,散點圖斜率代表暴露因素對結局的影響大小(causal effect)
上述分析流程非常清晰明瞭,還有MR STROBE寫作流程保駕護航,可謂人有多大膽,文有多大產。具體分析流程可參考下圖:
03
孟德爾隨機化的全球發文趨勢
2024年,在孟德爾隨機化研究領域,中國以發文量4837篇佔比83.25%,穩居第一,美國(479篇,8.24%)與英國(277篇,4.77%)次之。
其中,全球前十名中國佔據了90%!前三名分別為來自中國的四川大學(182篇)、首都醫科大學(176篇)和中南大學(176篇)。
04
孟德爾隨機化主要發文期刊
2024年,孟德爾隨機化相關文獻共發表6469篇,發文量排名前10的期刊見下圖。
其中刊載文獻量最多的期刊是Medicine (Baltimore)(265篇);Front Endocrinol (Lausanne)位居第二,刊載文獻量224篇;Sci Rep位居第三,刊載文獻量198篇。
05
孟德爾隨機化熱點關鍵詞
論文關鍵詞是對研究目的、研究物件、研究方法進行高度凝練與概括。基於關鍵詞的分析能夠反映某一研究領域某一時間段內主題演變趨勢和研究熱點。
下面我們就來盤點一下2024年度孟德爾隨機化領域的熱點關鍵詞,出現頻次前5的關鍵詞分別是:gut microbiota,causal relationship,causality,mendelian randomization analysis,gwas。
希望這些熱點詞可以給想用孟德爾隨機化發SCI的醫學黨一些啟發與靈感!
06
孟德爾隨機化入門攻略
知道了孟德爾隨機化火爆,瞭解了孟德爾隨機化的核心邏輯和分析流程,但是具體怎麼操作?到底怎麼樣才能利用孟德爾隨機化發SCI?
別急,此刻你只需要來看一看解螺旋專業科研團隊精心打造的「孟德爾隨機化1元伴學營」只需要每天抽出一小段時間,就算是0基礎小白也能輕鬆入門!
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