2020 年微軟更新身份驗證器 (Microsoft Authenticator) 帶來密碼儲存和自動填充功能，也就是微軟身份驗證器當時變成密碼管理器，並且支援在 iOS 和 Android 上實現自動填充。
不過這些功能從 2025 年 6 月起都要被逐漸停用，已經儲存的密碼都會被自動同步到 Microsoft Edge 中，微軟的做法其實也就是希望使用者全部使用 Edge 瀏覽器，但這也意味著微軟身份驗證器失去密碼管理器的功能。
下面是微軟身份驗證器的時間表：
從 2025 年 6 月起：微軟身份驗證器不再支援儲存新密碼
從 2025 年 7 月起：微軟身份驗證器不再支援自動填充功能
從 2025 年 8 月起：已經儲存的密碼不再支援透過微軟身份驗證器訪問
微軟身份驗證器仍然保留通行金鑰相關功能，要使用通行金鑰使用者需要在系統設定裡將其設定為通行金鑰提供商，例如 iOS 裡需要轉到設定、關於、自動填充和密碼、啟用自動填充和密碼、啟用微軟身份驗證器作為填充來源。
在 PC 端 Microsoft Edge 可以自動呼叫已經儲存的資料實現通行金鑰自動填充，整體來說如果使用者使用 Microsoft Edge 瀏覽器，那麼使用體驗幾乎沒有什麼變更，但如果使用者使用其他瀏覽器則可能會受到影響。
例如在 iOS 上使用 Chrome 瀏覽器，由於微軟身份驗證器不再支援儲存和填充密碼，那麼 Chrome 無法呼叫其中的資料進行填充，使用者可選換成 Chrome 自帶的密碼填充、iOS 自帶的密碼應用或者使用第三方密碼管理器。
如何遷移資料：PC 端訪問 Microsoft Edge 設定、個人資料、密碼、設定旁邊的小選單選擇匯出密碼，匯出密碼後再將其匯入到 Chrome 或其他密碼管理器即可。