如何用ImageJ對Westernblot條帶進行灰度分析

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Image J軟體:Windows 版本
第一步:軟體安裝
1. 下載地址:http://rsb.info.nih.gov/ij/download.html
2. 下載windows 32位帶Java版本,雙擊軟體安裝。
第二步:介面介紹
 軟體介面
第三步:圖片分析
1.下圖為樣板圖片
2. 匯入圖片:File> Open> Sample1.jpg
圖片匯入後,Sample1.jpg在新的視窗中開啟
3. 圖片型別設定:Image> Type> 8 bit
4. 去除圖片背景:Process> Subtract Background> …
4.1 Subtract Background 視窗:Rolling ball radius 設為50 pixels,勾選light background,可選preview,點選“OK”確定
5. 工具欄:選擇“矩形選框”
6. 最大化“Sample1.jpg”視窗,便於矩形選擇,矩形選擇第一個泳道
7. 標記“矩形選框”為1:矩形選擇後,調整矩形至合適大小,按下數字鍵“1”,或者Analyze> Gels> Select Fist Lane。
8. 選擇“泳道2”:拖動“1”的矩形框,會出現兩個矩形選框,拖動矩形框至泳道2,調整位置,並按下數字鍵“2”,Image J 會自動調整大小使“矩形框2”與“矩形框1”保持同一水平。
9. 繼續拖動,會出項新的“矩形選框”,調增至泳道3,並按下數字鍵“2”(注意:是按下數字鍵“2”),重複9至6個泳道全部選擇。
10. 所有泳道選擇後,按下數字鍵“3”,出現分析圖譜。
注:最好先不要對電泳圖加黑色線框,做完灰度分析之後再進行,就不會有下面所謂中間兩條線了。
11.“直線”封閉峰:工具欄選擇“直線”,從起峰處至落峰處。
12. 計算峰值:工具欄> Wand(tracing) tool,點下剛才封閉的區域,峰值結果出現在新的視窗中。
計算結果:
12.其他泳道,以此類推
剩下的就是將各條帶的資料繪圖啦,如果你有重複電泳就能畫出帶誤差線的柱狀圖來了。


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