加州在2012年推出了過渡性幼兒園（TK，TRANSITIONAL KINDERGARTEN）公立學校計劃，舊金山設有多處TK幼兒園，讓年尾9月2日～12月2日之間未滿5週歲的兒童多一年準備上幼兒園。

舊金山聯合學區還設有嬰幼兒及學齡前兒童方案，招收6個月大的嬰兒到學齡前兒童，接受需要資助的低收入家庭的小孩，和支付學費家庭的小孩。

舊金山聯合學區最近實施了新的中學一條龍系統（FEEDER SYSTEM），從2017年開始，每所舊金山小學直接指定到一個特定的初中。5年級學生畢業後，將自動升級到指定的初中。 如果不滿意指定的初中，家庭也可以申請參加不同的中學。 但在2017年之前，仍然透過抽籤擇校。

舊金山聯合學區引入新的學校指定方案，是為了連續性和簡化從小學至初中的過渡。也是為了平衡各個初中的入學人數，目前一些初中有長長的等候名單，而有的初中招生不足。主要原因是學校質量不同，如GIANNINI （A.P.）初中在GREATSCHOOLS上的評分是10，JAMES LICK 初中的評分只有4。 HOOVER初中也許是多家長和學生喜歡的熱門初中，提供許多選修課程和課外活動，例如“MINECRAFT  MONDAYS”，還有著名的音樂課程。

學區提供彩色圖案資訊，幫助家長明白初中指定系統。此外，家長需要對比不同的公立初中，瞭解榮譽課程、選修課程、學校的統計資料等。

同樣，由於舊金山沒有足夠多的好高中，申請舊金山高中也要經過申請初中類似的痛苦過程。要進入全美排名50，加州排名第9位的LOWELL 高中，學生必須透過資格考試。LOWELL 高中有2,648名學生， 提供廣泛的課程，包括八國語言（中國、法語、希伯來語、義大利語、日語、韓語、拉丁語、西班牙語）和許多AP和榮譽水平的課程，LOWELL 高中的音樂課程也很受受尊敬，還有多個全市最好的運動隊，以及豐富多樣的課外俱樂部和活動。

RUTH ASAWA 藝術學院（RUTH ASAWA SCHOOL OF THE ARTS，SOTA ）招收創意寫作、舞蹈、媒體、音樂和視覺藝術等方面的藝術人才，符合資格的申請人數遠遠高於學校的招生人數，學生必須在競爭激烈的試鏡過程中勝出才能入學。

伽利略科學技術學院（ GALILEO ACADEMY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY）為學生提供多種專業職業途徑，比如選擇媒體藝術途徑的學生，可以學習PHOTOSHOP、HTML和影片製作。

BALBOA高中也為11和12年級學生提供不同的職業方向課程，包括法律、傳媒、計算機科學、領導或環境科學。10年前，BALBOA高中因為表現不佳和團伙暴力，很多家庭都避免入學BALBOA高中。 但現在BALBOA高中也是舊金山最受歡迎的學校之一。

LOWELL 高中和RUTH ASAWA 藝術學院有自己單獨的申請程式，其它高中只需要一個申請。

舊金山學區有11所公立特許學校，也是舊金山家長的選擇之一，但必須單獨申請。

CREATIVE ARTS 特許學校是由一些希望有特定課程的家庭發起成立的，招收幼兒園到8年級學生。KIPP （KNOWLEDGE IS POWER PROGRAM）公立特許學校規模較大，在全國各地有多處學校，灣區的兩家KIPP分別坐落在BAYVIEW 和 WESTERN ADDITION社群。

GATEWAY 高中是一所大學預科學校，整個高中期間，透過學校提供的大學的諮詢網頁，為學生提供高等教育指導。即使是對高一的學生也引導他們“瞭解入學加州大學的要求”和“開始攢錢上大學”。GATEWAY 也有初中，有自己獨立的校園。

舊金山的FLEX學院，是一個新興的被稱作混合（ HYBRID）的新型學校。FLEX學院讓孩子們在網上自主學習，並且提供現場指導和輔導支援 。

特許學校都有自己的要求和期限，因此，家長需要自己到學校網站查詢，以及到CALIFORNIA CHARTER SCHOOL ASSOCIATION網站了解更多關於加州特許學校的資訊。

舊金山有90所私立學校和教會學校可供選擇，包括獨特的單一性別的THE HAMLIN 學校，招收幼兒園到8年級學生。 CATHEDRAL SCHOOL FOR BOYS 男子學校也招收兒園到8年級學生。 UNIVERSITY HIGH SCHOOL 和LICK- WILMERDING都是很有競爭力的學校。許多舊金山的天主教學校都頗受推崇，包括 ST. IGNATIUS 大學預科學校（ ST. IGNATIUS COLLEGE PREPARATORY SCHOOL），以其嚴謹的學術和體育聞名。

對有些不適合傳統學校環境的初中和高中學齡的孩子，可以在FUSION 學院（FUSION ACADEMY）獨立學習，FUSION 學院提供個性化的學習和靈活的日程安排。

要了解更多關於舊金山的公立、私立、教會和特許學校，建議家長到GREATSCHOOLS網站查詢學校評級和家長評論。